본 연구소는 아래와 같이 수학에 관한 국내외 연구협력 및 지원활동, 응용수학에 관한 산학협동 등을 설립목적으로 하고 있다.

첫째, 수학의 교육, 이론 및 그 응용에 관한 연구를 통하여, 우리나라의 수학 및 다른 학문과 산업 등 국가 발전에 기여한다.
둘째, 전국적인 공동 이용 연구소로서 전국 연구자들의 공동연구 중심이 되어, 국가적으로 보유하여야 할 수학정보센터의 구실을 한다.
셋째, 국제적인 연구 활동의 중심으로서, 우리나라의 연구가 선진국들과 견줄 수 있도록 국제 교류의 발판으로써의 역할을 한다.